敏腕パイロットとして民間航空会社に勤務するバリー・シール（トム・クルーズ）のもとに、ある日CIAのエージェントがやってきた。 CIAのスカウトを受けたバリーは、偵察機のパイロットとしてCIAの極秘作戦に参加。 作戦の過程で伝説的な麻薬王パブロ・エスコ…